功能注释

GO分析：将鉴定到的所有蛋白质集合或者筛选出的差异表达蛋白质注释到不同功能条目
KEGG分析：分析所有鉴定到的蛋白质集合或筛选出的差异表达蛋白质参与的最主要的代谢和信号转导途径

富集及聚类

富集：分析潜在主要功能、信号通路涉及的差异表达或修饰变化的蛋白
聚类：对功能富集、通路富集和表达模式等进行聚类

互作网络

确定蛋白与蛋白的互作网络图，直观的展示特定属性蛋白质间的相互作用情况。

Motif分析

分析翻译后修饰位点附近氨基酸分布情况，对于识别和发现新的修饰位点及调控机理具有重要指导作用。