简介

鉴于蛋白表达相对基因的时空调控特异性,对同一生物体受遗传因素和环境刺激条件下,蛋白组的差异变化研究显得尤为重要。定量蛋白质组学研究(差异蛋白质组)具有在整体水平上 发掘和寻求潜在药物靶点,同时适用于肿瘤等复杂疾病分类、早期诊断、阻断和治疗。

蛋白质定量变化的研究思路通常分为:Top-Down和Bottom-Up。随着近代质谱精度和数据算法水平的提高,基于蛋白质组碎裂肽段然后推导所有蛋白信息的Bottom-Up方式得以快速发展。 因其具备分辨率高、通量大等优势,在基础医学研究中备受青睐。

技术介绍

高通量定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)分析,因定量方法不同分为三种技术:
1.iTraq定量蛋白质组学:基于同位素体外标记
2.SILAC定量蛋白质组学:基于同位素体内标记
3.Label Free定量蛋白质组学:不适用同位素,通过标准肽进行定量

应用领域

鉴于取样来源的不同,三种定量技术应用范围不同:
iTraq方法主要应用在比较少量临床样品、动物模型之间的蛋白质组差异,或病原微生物蛋白质组差异比较。
SILAC方法主要应用于细胞系经药物处理或基因敲除、沉默过程中,蛋白质组差异比较。
Label Free方法通常应用于比较大规模临床样本间蛋白质组差异。