蛋白流动性

Protein Mobility & Dynamics · 时空蛋白质组

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概述

蛋白质转运与动力学的质谱解析。亚细胞流动性是指蛋白质及其他分子在细胞内的亚细胞定位并非固定不变,而是可在不同区室之间转运、交换或呈现多定位分布,并随细胞状态、时间、信号及感染等条件动态变化。空间蛋白质组学结合密度梯度分级、质谱定量、机器学习分类及活细胞/免疫荧光成像,能够在全蛋白质组尺度捕捉这些稳态快照与动态概率。亚细胞流动性是连接静态定位图谱与细胞器重塑、信号转导、发育分化、宿主—病原互作及进化适应的关键维度,它有助于从“蛋白质在哪里”推进到“蛋白质如何移动、何时移动以及为何移动”。

技术优势

实验流程

细胞培养与收集Cell Culture细胞破碎氮气空化差速离心富集膜性颗粒密度梯度离心碘克沙醇分级组分收集蛋白质沉淀胰蛋白酶消化Trypsin高pH反相预分级RP PrefractionationLC-SPS-MS³质谱定量数据归一化降维可视化 PCA/t-SNE无监督聚类HDBSCAN有监督贝叶斯分类Bayesian

具体流程将根据样品类型与项目目标定制,最终以技术方案为准。

应用方向

转录因子核质穿梭机制研究
蛋白降解药物(PROTAC)动力学评估
应激刺激下蛋白重定位全景

送样建议

细胞样品≥ 5×10⁶ 个细胞/样品PBS 清洗后离心去除上清,液氮速冻,干冰运输
组织样品≥ 50 mg/样品新鲜组织液氮速冻,-80 °C 保存,干冰运输
体液样品血清/血浆 ≥ 100 µL低速离心取上清,-80 °C 保存,干冰运输
重复要求每组生物学重复 ≥ 3建议设置阴/阳性对照或内参样品

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