空间蛋白质组学

Spatial Proteomics · 时空蛋白质组

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概述

保留空间信息的原位蛋白质组。通过激光显微切割(LMD)或空间条形码策略,对组织切片特定区域(如肿瘤浸润前沿、皮质层、坏死区)分别取样进行蛋白质组定量,将蛋白表达与组织空间位置关联,避免匀浆导致的空间信息丢失。

技术优势

实验流程

显微切割激光显微切割均质细胞超声裂解聚焦超声释放蛋白蛋白质控选取小孔样本质控蛋白酶解Trypsin 各位管酶解肽段脱盐Strata-X C18 脱盐LC-MS 采集DDA 模式数据分析空间蛋白图谱

具体流程将根据样品类型与项目目标定制,最终以技术方案为准。

应用方向

肿瘤核心 vs 边缘区蛋白谱比较
脑/肝等分区器官的区带蛋白图谱
免疫浸润热点区域蛋白质组分析

送样建议

细胞样品≥ 5×10⁶ 个细胞/样品PBS 清洗后离心去除上清,液氮速冻,干冰运输
组织样品≥ 50 mg/样品新鲜组织液氮速冻,-80 °C 保存,干冰运输
体液样品血清/血浆 ≥ 100 µL低速离心取上清,-80 °C 保存,干冰运输
重复要求每组生物学重复 ≥ 3建议设置阴/阳性对照或内参样品

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