全蛋白修饰组学 · 硫酸软骨素化

Proteome-wide CSylation Omics

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概述

硫酸软骨素化(CSylation)指核心蛋白特定丝氨酸位点连接硫酸软骨素糖胺聚糖链的修饰,构成蛋白聚糖(如agrin、brevican)的功能基础,参与细胞外基质组装、神经发育与肿瘤微环境构建。

技术原理

硫酸软骨素化修饰目前尚无成熟的特异性富集材料,我们采用超高深度分级蛋白质组 + 谱图直接鉴定策略:样品经高 pH 反向分级增加分离维度,配合长梯度液相与 DDA/DIA 混合采集,直接从全扫描数据中鉴定硫酸软骨素化修饰肽段,并通过靶向 PRM 验证关键位点。

技术优势

实验流程

样品制备细胞 / 组织蛋白提取与酶解Trypsin超高深度直接鉴定DetectionLC-MS/MS检测Orbitrap数据分析与报告修饰位点定量

应用方向

抗体药物糖型谱与质量控制(CMC)
蛋白折叠、稳定性与免疫原性研究
O-GlcNAc 与营养感知信号研究
细胞外基质与肿瘤微环境研究

送样建议

细胞样品≥ 5×10⁶ 个细胞/样品裂解前 PBS 清洗,含去修饰酶抑制剂裂解液处理
组织样品≥ 50 mg/样品液氮速冻研磨,-80 °C 保存,干冰运输
蛋白总量≥ 1–2 mg/样品(富集前)BCA 定量,避免高盐/去污剂残留
重复要求每组生物学重复 ≥ 3组间样品处理条件保持一致

参考文献

该修饰类型属于新近系统鉴定的新型翻译后修饰,文献仍在快速积累。我们的技术团队持续跟踪最新研究进展,欢迎联系我们获取该修饰类型的定制研究方案与文献支持。

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