全蛋白修饰组学 · 瓜氨酸化

Proteome-wide Citrullination Omics

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概述

瓜氨酸化由PAD酶家族将精氨酸转化为瓜氨酸,改变蛋白电荷与结构。瓜氨酸化组蛋白参与中性粒细胞胞外陷阱(NETs)形成与自身免疫表位暴露,抗瓜氨酸化蛋白抗体(ACPA)是类风湿关节炎分类标准的核心指标,也是肿瘤免疫治疗新兴研究热点。

技术原理

酶解肽段与高亲和力瓜氨酸化泛抗体(anti-Kcit)偶联的磁珠/琼脂糖凝胶在 4 °C 孵育过夜,特异性捕获携带瓜氨酸化修饰的肽段;经充分洗涤去除非修饰背景后洗脱,修饰肽段富集倍数可达百倍以上。富集产物进入高分辨 LC-MS/MS,在数据库检索中以Citrullination为可变修饰完成位点鉴定;结合 SILAC / TMT / DIA 等定量策略,即可实现全蛋白水平瓜氨酸化修饰组的精确相对定量,进而筛选瓜氨酸化修饰调控的关键蛋白与位点。必要时亦可并行采用化学衍生/探针路线交叉验证。

技术优势

实验流程

样品制备细胞 / 组织蛋白提取与酶解Trypsin化学衍生+高效富集EnrichmentLC-MS/MS检测Orbitrap数据分析与报告修饰位点定量

应用方向

PARP 抑制剂药理机制与 DNA 损伤修复研究
类风湿关节炎 ACPA 与自身免疫表位研究
肽类激素加工与内分泌研究
营养-代谢暴露的蛋白层面标记研究

送样建议

细胞样品≥ 5×10⁶ 个细胞/样品裂解前 PBS 清洗,含去修饰酶抑制剂裂解液处理
组织样品≥ 50 mg/样品液氮速冻研磨,-80 °C 保存,干冰运输
蛋白总量≥ 1–2 mg/样品(富集前)BCA 定量,避免高盐/去污剂残留
重复要求每组生物学重复 ≥ 3组间样品处理条件保持一致

参考文献

[1] Li P, Li M, Lindberg MR, et al. PAD4 is essential for antibacterial innate immunity mediated by neutrophil extracellular traps. J Exp Med. 2010, 207(9):1853-1862.

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