全蛋白修饰组学 · 谷氨酰化

Proteome-wide Glutamylation Omics

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概述

谷氨酰化由谷氨酸供体生成;微管蛋白多谷氨酰化(polyglutamylation)是该修饰家族的经典体系,由 TTLL 谷氨酰化酶与 CCP 去谷氨酰化酶调控,参与纤毛/鞭毛运动与神经功能。

技术原理

谷氨酰化修饰目前尚无成熟的特异性富集材料,我们采用超高深度分级蛋白质组 + 谱图直接鉴定策略:样品经高 pH 反向分级增加分离维度,配合长梯度液相与 DDA/DIA 混合采集,直接从全扫描数据中鉴定谷氨酰化修饰肽段,并通过靶向 PRM 验证关键位点。

技术优势

实验流程

样品制备细胞 / 组织蛋白提取与酶解Trypsin超高深度直接鉴定DetectionLC-MS/MS检测Orbitrap数据分析与报告修饰位点定量

应用方向

游离氨基酸代谢库与蛋白功能的偶联研究
支链/芳香族氨基酸代谢重塑与遗传代谢病
肠道菌群-宿主氨基酸代谢互作
肿瘤氨基酸依赖性代谢(谷氨酰胺/天冬酰胺)研究

送样建议

细胞样品≥ 5×10⁶ 个细胞/样品裂解前 PBS 清洗,含去修饰酶抑制剂裂解液处理
组织样品≥ 50 mg/样品液氮速冻研磨,-80 °C 保存,干冰运输
蛋白总量≥ 1–2 mg/样品(富集前)BCA 定量,避免高盐/去污剂残留
重复要求每组生物学重复 ≥ 3组间样品处理条件保持一致

参考文献

[1] Rogowski K, van Dijk J, Magiera MM, et al. A family of protein-deglutamylating enzymes associated with neurodegeneration. Cell. 2010, 143(4):564-578.

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