全蛋白修饰组学 · 琥珀酰化

Proteome-wide Succinylation Omics

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概述

赖氨酸琥珀酰化(Ksu)由三羧酸循环中间体琥珀酰CoA供体化产生,带负电的琥珀酰基可显著改变蛋白表面电荷与活性。琥珀酰化高度富集于线粒体代谢酶,SIRT5为其主要去琥珀酰化酶,与代谢性疾病、心血管疾病及肿瘤代谢密切相关。

技术原理

酶解肽段与高亲和力琥珀酰化修饰泛抗体(anti-Succinylation)偶联的磁珠/琼脂糖凝胶在 4 °C 孵育过夜,特异性捕获携带琥珀酰化修饰的肽段;经充分洗涤去除非修饰背景后洗脱,修饰肽段富集倍数可达百倍以上。富集产物进入高分辨 LC-MS/MS 检测,在数据库检索中以Succinylation为可变修饰完成位点鉴定;结合 SILAC / TMT / DIA 等定量策略,即可实现全蛋白水平琥珀酰化修饰组的精确相对定量,进而筛选琥珀酰化修饰调控的关键蛋白与位点。

技术优势

实验流程

样品制备细胞 / 组织蛋白提取与酶解Trypsin琥珀酰化修饰肽段亲和富集EnrichmentLC-MS/MS检测Orbitrap数据分析与报告修饰位点定量

应用方向

代谢重塑与酰基CoA代谢通量研究
表观遗传与基因转录调控
肿瘤及代谢性疾病的修饰标志物发现
HDAC/SIRT 等修饰酶调节剂的药理机制研究

送样建议

细胞样品≥ 5×10⁶ 个细胞/样品裂解前 PBS 清洗,含去修饰酶抑制剂裂解液处理
组织样品≥ 50 mg/样品液氮速冻研磨,-80 °C 保存,干冰运输
蛋白总量≥ 1–2 mg/样品(富集前)BCA 定量,避免高盐/去污剂残留
重复要求每组生物学重复 ≥ 3组间样品处理条件保持一致

参考文献

[1] Rardin MJ, He W, Nishida Y, et al. SIRT5 regulates the mitochondrial lysine succinylome and metabolic networks. Cell Metab. 2013, 18(6):920-933.

[2] Weinert BT, Schölz C, Wagner SA, et al. Lysine succinylation is a frequently occurring modification in prokaryotes and eukaryotes and extensively overlaps with acetylation. Cell Rep. 2013, 4(4):842-851.

配套试剂盒

本服务所用琥珀酰化修饰肽段亲和富集材料同步以试剂盒形式销售,支持自建流程。

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